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AliviewVer
aliview AliView es un editor/visor de alineamientos, optimizado para ser rápido aún con archivos extensos. Para ejecutarlo inicie una sesión ssh que le permita en...
AnacondaVer
Anaconda Es un software de distribución libre y abierta para administrar paquetes para los lenguajes Python y R, está pensado especialmente para cómputo científic...
AutoconfVer
autoconf Es un software para Uso de autoconf Para cargar el módulo de autoconf usted puede usar los siguientes comandos: * module load tools/autoconf/2.63 ...
AutomakeVer
Automake Es un software para Uso de Automake Para cargar el módulo de Automake usted puede usar el comando: * module load tools/automake/1.11.1 o alternativam...
BBMapVer
BBMap Es un sotware alineador de empalme rápido para ARN y ADN. Es más rápido que casi todos los alineadores de lectura corta, pero conserva una sensibilidad y es...
BerkeleyDBVer
Berkeley DB Es un software para Uso de Berkeley DB Para cargar el módulo de Berkeley DB usted puede usar el comando: * module load DB/BerkeleyDB/6.2.23 Version...
BlastPlusVer
Blast Es un conjuto de herramientas para la linea de comandos para correr Blast. Estas herramientas le permiten al usuario ejecutar sus propias busquedas con Bla...
BlastVer
Blast Es un software que permite encontrar regiones de similaridad entre secuencias biologicas. Este software compara secuncias de nucleótidos o proteínas contra ...
BlcrVer
blcr Es un software para Uso de blcr Para cargar el módulo de blcr usted puede usar el comando: * module load MPI/blcr/0.8.5 Versiones disponibles de blcr ...
BoostVer
Boost Es un software para Uso de Boost Para cargar el módulo de Boost usted puede usar el comando: * module load library/boost/1.73 o alternativamente: * mo...
Bowtie2Ver
Bowtie2 Es un paquete de software comunmente usado para hacer alineamiento y análisis de secuencias (ADN, ARN, etc.) en bioinformatica. Uso de Bowtie2 Para cargar...
BwaVer
BWA Es un paquete de software usado para mapear secuencias poco divergentes contra un genoma grande de referencia, usando tres algoritmos: BWA backtrack, BWA SW y...
CPCVer
CPC (Coding Potential Calculator) Es un software para Uso de CPC Para cargar el módulo de CPC usted puede usar los siguientes comandos: * module load apps/cpc/...
CdhitVer
CD HIT Es un software para clusterizar y comparar secuencias de proteínas y nucleótidos, este programa es capaz de manejar sin problema bases de datos con una can...
ClustalVer
Clustal Es un software para hacer alienaminetos de multiples secuencias mediante el uso de árboles con semilla y técnicas de perfil perfil HMM para generar alinea...
CmakeVer
Cmake Es un software para Uso de Cmake Para cargar el módulo de Cmake usted puede usar el comando: * module load tools/cmake/3.17 o alternativamente: * mo...
Containers
Main.AdminUser 06 Dec 2024 Containers Un container es una entidad aislada que provee un ambiente de software para una aplicacion y sus dependencias en una imagen...
Correrengpu
Main.AdminUser 15 May 2023 Correr en GPU La unidad de procesamiento gráfico (GPU) ubicada en la tarjeta grafica es un coprocesador dedicado al procesamiento de g...
CurlVer
curl Es un software para Uso de curl Para cargar el módulo de curl usted puede usar el comando: * module load curl/7.47 o alternativamente: * module load c...
DiagramaUsoGeneral
Main.AdminUser 27 Nov 2023 nop DiagramaUsoGeneral This plugin allows you to create a flowchart from topic text. Example center Stop the mouse above each i...
DiamondVer
Diamond Es un software para Uso de Diamond Para cargar el módulo de Diamond usted puede usar el comando: * module load apps/diamond/2.0.13 Versiones disponib...
DirectivasSLURM
Main.AdminUser 20 Mar 2023 Directivas SLURM mas usadas Descripcion del recursos a reservar Directiva SLURM sintaxis corta /sintaxis larga Variable utili...
DotVer
dot Es un software para Uso de dot Para cargar el módulo de dot usted puede usar el comando: * module load dot Versiones disponibles de dot * versión ???
ExonerateVer
Exonerate Es un software que permite la comparación de secuencuencias por pares usando diversos modelos de alineamiento, ya sea usando programación dinamca exhaus...
FastQCVer
FastQC Es un software para Uso de Fast QC Para cargar el módulo de Fast QC usted puede usar el comando: * module load apps/FastQC/0.11.5 Versiones disponible...
FastqpuriVer
Fastqpuri Es un software para Uso de Fastqpuri Para cargar el módulo de Fastqpuri usted puede usar el comando: * module load apps/Fastqpuri/1.0.6 o alternativa...
Flash2Ver
Flash 2 Es un software para Uso de Flash 2 Para cargar el módulo de Flash 2 usted puede usar el comando: * module load apps/flash2/2.2 Versiones disponibles ...
GMAPVer
Gmap Es un software que permite el alineamiento y mapeo genomico de secuencias ARNm y EST. Uso de GMAP Para cargar el módulo de GMAP usted puede usar el comando: ...
GMPVer
GMP Es un software para Uso de GMP Para cargar el módulo de GMP usted puede usar el comando: * module load library/gmp/6.2 Versiones disponibles GMP * versi...
GaussianVer
Gaussian Es un software para Uso de Gaussian Para cargar el módulo de Gaussian usted puede usar el comando: * module load apps/gaussian/16 Versiones disponibl...
GccVer
GCC Es un software para Uso de GCC Para cargar el módulo de GCC usted puede usar el comando: * module load lang/gcc/9.2 o alternativamente: * module load la...
Geant4Ver
Geant4 Es un software para Uso de Geant4 Para cargar el módulo de Geant4 usted puede usar los siguientes comandos: * module load apps/geant/4.10 * module lo...
GitVer
Git Es un software para Uso de Git Para cargar el módulo de Git usted puede usar el comando: * module load apps/git/2.6 Versiones disponibles de Git * vers...
GlimmerVer
Glimmer Es un software para Uso de Glimmer Para cargar el módulo de Glimmer usted puede usar el comando: * module load apps/glimmer/3.02 Versiones disponibles ...
GnuplotVer
Gnuplot Es un software para Uso de Gnuplot Para cargar el módulo de Gnuplot usted puede usar el comando: * module load apps/gnuplot/5.2.7 Versiones disponible...
GslVer
GSL Es un software para Uso de GSL Para cargar el módulo de GSL usted puede usar el comando: * module load library/gsl/2.6 Versiones disponibles GSL * versi...
HMMERVer
HMMER Es un software para Uso de HMMER Para cargar el módulo de HMMER usted puede usar el comando: * module load apps/HMMER/3.3.2 o alternativamente: * modu...
Hisat2Ver
Hisat Es un software de alineación rápido para mapear lecturas de secuenciación de siguiente generación (tanto ADN como ARN) a una población de genomas humanos, a...
HwlocVer
Hwloc Es un software para Uso de Hwloc Para cargar el módulo de Hwloc usted puede usar el comando: * module load lang/hwloc/2.2.0 Versiones disponibles de Hwlo...
HypreVer
Hypre Es un software para Uso de Hypre Para cargar el módulo de Hypre usted puede usar el comando: * module load library/hypre/2.19 o alternativamente: * mo...
IconvVer
Iconv Es un software para Uso de Iconv Para cargar el módulo de Iconv usted puede usar el comando: * module load library/iconv/1.16 Versiones disponibles Iconv...
InfernalVer
Infernal Es un software para Uso de Infernal Para cargar el módulo de Infernal usted puede usar el comando: * module load apps/infernal/1.1.4 Versiones dispon...
JavaSEVer
Java SE Es un software para Uso de Java SE Para cargar el módulo de Hwloc usted puede usar el comando: * module load lang/javaSE/14.0 Versiones disponibles de ...
JellyfishVer
Jellyfish Es un software para Uso de Jellyfish Para cargar el módulo de Jellyfish usted puede usar el comando: * module load apps/Jellyfish/2.3.0 Versiones di...
LAMPSVer
LAMPS Es un software para Uso de LAMPS Para cargar el módulo de LAMPS usted puede usar el comando: * module load apps/LAMPS/1.0 Versiones disponibles de LAMPS ...
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Lapack Es un software para Uso de Lapack Para cargar el módulo de Lapack usted puede usar el comando: * module load library/lapack/3.8.0 Versiones disponibles ...
LibblasVer
Libblas Es un software para Uso de Libblas Para cargar el módulo de Libblas usted puede usar el comando: * module load library/libblas/3.10.0 Versiones disponi...
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Libgff Es un software para Uso de Libgff Para cargar el módulo de Libgff usted puede usar el comando: * module load library/libgff/2014.10.7 Versiones disponib...
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Libtool Es un software para Uso de Libtool Para cargar el módulo de Libtool usted puede usar el comando: * module load tools/libtool/2.4 o alternativamente: ...
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LLVM Es un software para Uso de LLVM Para cargar el módulo de LLVM usted puede usar el comando: * module load lang/llvm/5.0 Versiones disponibles de LLVM * ...
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Topic revision: r1 - 28 Nov 2022, AdminUser
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