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AliviewVer
aliview AliView es un editor/visor de alineamientos, optimizado para ser rápido aún con archivos extensos. Para ejecutarlo inicie una sesión ssh que le permita en...
AnacondaVer
Anaconda Es un software de distribución libre y abierta para administrar paquetes para los lenguajes Python y R, está pensado especialmente para cómputo científic...
AutoconfVer
autoconf Es un software para Uso de autoconf Para cargar el módulo de autoconf usted puede usar los siguientes comandos: * module load tools/autoconf/2.63 ...
AutomakeVer
Automake Es un software para Uso de Automake Para cargar el módulo de Automake usted puede usar el comando: * module load tools/automake/1.11.1 o alternativam...
BBMapVer
BBMap Es un sotware alineador de empalme rápido para ARN y ADN. Es más rápido que casi todos los alineadores de lectura corta, pero conserva una sensibilidad y es...
BerkeleyDBVer
Berkeley DB Es un software para Uso de Berkeley DB Para cargar el módulo de Berkeley DB usted puede usar el comando: * module load DB/BerkeleyDB/6.2.23 Version...
BlastPlusVer
Blast Es un conjuto de herramientas para la linea de comandos para correr Blast. Estas herramientas le permiten al usuario ejecutar sus propias busquedas con Bla...
BlastVer
Blast Es un software que permite encontrar regiones de similaridad entre secuencias biologicas. Este software compara secuncias de nucleótidos o proteínas contra ...
BlcrVer
blcr Es un software para Uso de blcr Para cargar el módulo de blcr usted puede usar el comando: * module load MPI/blcr/0.8.5 Versiones disponibles de blcr ...
BoostVer
Boost Es un software para Uso de Boost Para cargar el módulo de Boost usted puede usar el comando: * module load library/boost/1.73 o alternativamente: * mo...
Bowtie2Ver
Bowtie2 Es un paquete de software comunmente usado para hacer alineamiento y análisis de secuencias (ADN, ARN, etc.) en bioinformatica. Uso de Bowtie2 Para cargar...
BwaVer
BWA Es un paquete de software usado para mapear secuencias poco divergentes contra un genoma grande de referencia, usando tres algoritmos: BWA backtrack, BWA SW y...
CPCVer
CPC (Coding Potential Calculator) Es un software para Uso de CPC Para cargar el módulo de CPC usted puede usar los siguientes comandos: * module load apps/cpc/...
CdhitVer
CD HIT Es un software para clusterizar y comparar secuencias de proteínas y nucleótidos, este programa es capaz de manejar sin problema bases de datos con una can...
ClustalVer
Clustal Es un software para hacer alienaminetos de multiples secuencias mediante el uso de árboles con semilla y técnicas de perfil perfil HMM para generar alinea...
CmakeVer
Cmake Es un software para Uso de Cmake Para cargar el módulo de Cmake usted puede usar el comando: * module load tools/cmake/3.17 o alternativamente: * mo...
Containers
Main.AdminUser 06 Dec 2024 Containers Un container es una entidad aislada que provee un ambiente de software para una aplicacion y sus dependencias en una imagen...
CurlVer
curl Es un software para Uso de curl Para cargar el módulo de curl usted puede usar el comando: * module load curl/7.47 o alternativamente: * module load c...
DiamondVer
Diamond Es un software para Uso de Diamond Para cargar el módulo de Diamond usted puede usar el comando: * module load apps/diamond/2.0.13 Versiones disponib...
DotVer
dot Es un software para Uso de dot Para cargar el módulo de dot usted puede usar el comando: * module load dot Versiones disponibles de dot * versión ???
ExonerateVer
Exonerate Es un software que permite la comparación de secuencuencias por pares usando diversos modelos de alineamiento, ya sea usando programación dinamca exhaus...
FastQCVer
FastQC Es un software para Uso de Fast QC Para cargar el módulo de Fast QC usted puede usar el comando: * module load apps/FastQC/0.11.5 Versiones disponible...
FastqpuriVer
Fastqpuri Es un software para Uso de Fastqpuri Para cargar el módulo de Fastqpuri usted puede usar el comando: * module load apps/Fastqpuri/1.0.6 o alternativa...
Flash2Ver
Flash 2 Es un software para Uso de Flash 2 Para cargar el módulo de Flash 2 usted puede usar el comando: * module load apps/flash2/2.2 Versiones disponibles ...
GMAPVer
Gmap Es un software que permite el alineamiento y mapeo genomico de secuencias ARNm y EST. Uso de GMAP Para cargar el módulo de GMAP usted puede usar el comando: ...
GMPVer
GMP Es un software para Uso de GMP Para cargar el módulo de GMP usted puede usar el comando: * module load library/gmp/6.2 Versiones disponibles GMP * versi...
GaussianVer
Gaussian Es un software para Uso de Gaussian Para cargar el módulo de Gaussian usted puede usar el comando: * module load apps/gaussian/16 Versiones disponibl...
GccVer
GCC Es un software para Uso de GCC Para cargar el módulo de GCC usted puede usar el comando: * module load lang/gcc/9.2 o alternativamente: * module load la...
Geant4Ver
Geant4 Es un software para Uso de Geant4 Para cargar el módulo de Geant4 usted puede usar los siguientes comandos: * module load apps/geant/4.10 * module lo...
GitVer
Git Es un software para Uso de Git Para cargar el módulo de Git usted puede usar el comando: * module load apps/git/2.6 Versiones disponibles de Git * vers...
GlimmerVer
Glimmer Es un software para Uso de Glimmer Para cargar el módulo de Glimmer usted puede usar el comando: * module load apps/glimmer/3.02 Versiones disponibles ...
GnuplotVer
Gnuplot Es un software para Uso de Gnuplot Para cargar el módulo de Gnuplot usted puede usar el comando: * module load apps/gnuplot/5.2.7 Versiones disponible...
GslVer
GSL Es un software para Uso de GSL Para cargar el módulo de GSL usted puede usar el comando: * module load library/gsl/2.6 Versiones disponibles GSL * versi...
HMMERVer
HMMER Es un software para Uso de HMMER Para cargar el módulo de HMMER usted puede usar el comando: * module load apps/HMMER/3.3.2 o alternativamente: * modu...
Hisat2Ver
Hisat Es un software de alineación rápido para mapear lecturas de secuenciación de siguiente generación (tanto ADN como ARN) a una población de genomas humanos, a...
HwlocVer
Hwloc Es un software para Uso de Hwloc Para cargar el módulo de Hwloc usted puede usar el comando: * module load lang/hwloc/2.2.0 Versiones disponibles de Hwlo...
HypreVer
Hypre Es un software para Uso de Hypre Para cargar el módulo de Hypre usted puede usar el comando: * module load library/hypre/2.19 o alternativamente: * mo...
IconvVer
Iconv Es un software para Uso de Iconv Para cargar el módulo de Iconv usted puede usar el comando: * module load library/iconv/1.16 Versiones disponibles Iconv...
InfernalVer
Infernal Es un software para Uso de Infernal Para cargar el módulo de Infernal usted puede usar el comando: * module load apps/infernal/1.1.4 Versiones dispon...
JavaSEVer
Java SE Es un software para Uso de Java SE Para cargar el módulo de Hwloc usted puede usar el comando: * module load lang/javaSE/14.0 Versiones disponibles de ...
JellyfishVer
Jellyfish Es un software para Uso de Jellyfish Para cargar el módulo de Jellyfish usted puede usar el comando: * module load apps/Jellyfish/2.3.0 Versiones di...
LAMPSVer
LAMPS Es un software para Uso de LAMPS Para cargar el módulo de LAMPS usted puede usar el comando: * module load apps/LAMPS/1.0 Versiones disponibles de LAMPS ...
LapackVer
Lapack Es un software para Uso de Lapack Para cargar el módulo de Lapack usted puede usar el comando: * module load library/lapack/3.8.0 Versiones disponibles ...
LibblasVer
Libblas Es un software para Uso de Libblas Para cargar el módulo de Libblas usted puede usar el comando: * module load library/libblas/3.10.0 Versiones disponi...
LibgffVer
Libgff Es un software para Uso de Libgff Para cargar el módulo de Libgff usted puede usar el comando: * module load library/libgff/2014.10.7 Versiones disponib...
LibtoolVer
Libtool Es un software para Uso de Libtool Para cargar el módulo de Libtool usted puede usar el comando: * module load tools/libtool/2.4 o alternativamente: ...
LlvmVer
LLVM Es un software para Uso de LLVM Para cargar el módulo de LLVM usted puede usar el comando: * module load lang/llvm/5.0 Versiones disponibles de LLVM * ...
LocarnaVer
Locarna Es un software para Uso de Locarna Para cargar el módulo de Locarna usted puede usar el comando: * module load apps/locarna/1.9.2.1 Versiones disponibl...
MPFRVer
MPFR Es un software para Uso de MPFR Para cargar el módulo de MPFR usted puede usar el comando: * module load library/mpfr/4.0 Versiones disponibles MPFR * ...
MakeVer
Make Es un software para Uso de Make Para cargar el módulo de Make usted puede usar el comando: * module load tools/make/4.3 Versiones disponibles de Make ...
MegahitVer
Megahit Es un software para Uso de Megahit Para cargar el módulo de Megahit usted puede usar el comando: * module load apps/megahit/1.2.9 Versiones disponibles...
MetisVer
Metis Es un software para Uso de Metis Para cargar el módulo de Metis usted puede usar el comando: * module load library/metis/5.1.0 Versiones disponibles Meti...
MmseqsVer
mmseqs Es un software para Uso de mmseqs Para cargar el módulo de mmseqs usted puede usar el comando: * module load apps/mmseqs/master Versiones disponibles de...
ModulesHPC
Main.AdminUser 26 Jan 2024 Software Instalado como Módulos Un "módulo" es un archivo que contiene la información requerida para configurar y disponer una aplicac...
MpichVer
Mpich Es un software para Uso de Mpich Para cargar el módulo de Mpich usted puede usar el comando: * module load MPI/mpich/3.2 o alternativamente: * modul...
MuscleVer
Muscle Es un software para Uso de Muscle Para cargar el módulo de Muscle usted puede usar el comando: * module load apps/muscle/3.8.425 Versiones disponibles d...
NCBIDatasets
NCBI Datasets Es un Dataset con Versiones disponibles del Dataset * versión 14.0.1
NcursesVer
Ncurses Es un software para Uso de Ncurses Para cargar el módulo de Ncurses usted puede usar el comando: * module load library/ncurses/6.2 Versiones disponible...
OneTBBVer
OneTBB Es un software para Uso de One Tbb Para cargar el módulo de One TBB usted puede usar el comando: * module load library/oneTBB/2021.5.0 Versiones disponi...
OpenSSlVer
Open SSl Es un software para Uso de Open SSl Para cargar el módulo de Open SSl usted puede usar el comando: * module load library/openSSl/1.1.1l o alternativa...
OpenmpiVer
Openmpi Es un software para Uso de Openmpi Para cargar el módulo de Openmpi usted puede usar los siguientes comandos: * module load MPI/openmpi/1.8.1 * modu...
OrthofinderVer
Orthofinder Es un software para Uso de Orthofinder Para cargar el módulo de Orthofinder usted puede usar el comando: * module load apps/Orthofinder/2.5.4 Versi...
PcreVer
Pcre Es un software para Uso de Pcre Para cargar el módulo de Pcre usted puede usar el comando: * module load pcre/8.42 Versiones disponibles de Pcre * ver...
PhymlVer
Phyml Es un software para Uso de Phyml Para cargar el módulo de Phyml usted puede usar el comando: * module load apps/phyml/mpi Versiones disponibles de Phyml ...
PicardVer
Picard Es un software para Uso de Picard Para cargar el módulo de Picard usted puede usar el comando: * module load apps/picard/2.25.5 Versiones disponibles de...
PmapVer
Pmap Es un software para Uso de Pmap Para cargar el módulo de Pmap usted puede usar el comando: * module load apps/pmap/11_25_2010 Versiones disponibles de Pma...
ProdigalVer
Prodigal Es un software para Uso de Prodigal Para cargar el módulo de Prodigal usted puede usar el comando: * module load apps/prodigal/2.6.3 Versiones disponi...
ProovreadVer
Proovread Es un software para Uso de Proovread Para cargar el módulo de Proovread usted puede usar el comando: * module load apps/proovread/2.14.0 Versiones di...
QeVer
Qe Es un software para Uso de Qe Para cargar el módulo de Qe usted puede usar el comando: * module load apps/qe/6.5 Versiones disponibles de Qe * versión 6....
QuastVer
Quast Es un software para Uso de Quast Para cargar el módulo de Quast usted puede usar el comando: * module load apps/quast/5.0.2 Versiones disponibles de Quas...
R-scapeVer
R scape Es un software para Uso de R scape Para cargar el módulo de R scape usted puede usar el comando: * module load apps/R scape_threads/1.5.16 o alternativ...
RNA-QC-ChainVer
RNA QC Chain Es un software para Uso de RNA QC Chain Para cargar el módulo de RNA QC Chain usted puede usar el comando: * module load apps/RNA QC Chain/1.0 Ver...
RNAsnpVer
RNAsnp Es un software para Uso de RNAsnp Para cargar el módulo de RNAsnp usted puede usar el comando: * module load apps/RNAsnp/1.2 Versiones disponibles de RN...
RNAzVer
RNAz Es un software para Uso de RNAz Para cargar el módulo de RNAz usted puede usar el comando: * module load apps/RNAz/2.1.1 Versiones disponibles de RNAz ...
RVer
R Es un software para Uso de R Para cargar el módulo de R usted puede usar el comando: * module load apps/R/3.6.1 o alternativamente: * module load apps/R/4...
RubyVer
Ruby Es un software para Uso de Ruby Para cargar el módulo de Ruby usted puede usar el comando: * module load lang/ruby/2.6 o alternativamente: * module loa...
SAMVer
SAM Es un software para Uso de SAM Para cargar el módulo de SAM usted puede usar el comando: * module load apps/samtools/1.3.1 Versiones disponibles de SAM ...
SSS-testVer
SSS test Es un software para Uso de SSS test Para cargar el módulo de SSS test usted puede usar el comando: * module load apps/SSS test/17.02.2021 Versiones di...
STARVer
STAR Es un software para Uso de STAR Para cargar el módulo de STAR usted puede usar el comando: * module load apps/aligners/STAR/2.7.10a Versiones disponible...
SalmonVer
Salmon Es un software para Uso de Salmon Para cargar el módulo de Salmon usted puede usar el comando: * module load apps/salmon/1.9 o alternativamente: * mo...
SpadesVer
Spades Es un software para Uso de Spades Para cargar el módulo de Spades usted puede usar los siguientes comandos: * module load apps/spades/3.14 * module l...
SparsehashVer
Sparsehash Es un software para Uso de Sparsehash Para cargar el módulo de Sparsehash usted puede usar el comando: * module load library/openSSl/1.1.1l Version...
SratoolkitVer
Sratoolkit Es un software para Uso de Sratoolkit Para cargar el módulo de Sratoolkit usted puede usar el comando: * module load apps/sratoolkit/2.11 Versiones...
StringtieVer
Stringtie Es un software para Uso de Stringtie Para cargar el módulo de Stringtie usted puede usar el comando: * module load apps/stringtie/v2.2.1 Versiones di...
SundialsVer
Sundials Es un software para Uso de Sundials Para cargar el módulo de Sundials usted puede usar el comando: * module load library/sundials/5.7.0 Versiones dis...
TransdecoderVer
Transdecoder Es un software para Uso de Transdecoder Para cargar el módulo de Transdecoder usted puede usar el comando: * module load apps/Transdecoder/5.5.0 V...
TrimGaloreVer
TrimGalore Es un software para Uso de Trim Galore Para cargar el módulo de Trim Galore usted puede usar el comando: * module load apps/TrimGalore/0.6.5 Version...
TrimmomaticVer
trimmomatic Es un software para Uso de trimmomatic Para cargar el módulo de trimmomatic usted puede usar el comando: * module load apps/trimmomatic/0.36 o alt...
ValgrindVer
Valgrind Es un software para Uso de Valgrind Para cargar el módulo de Valgrind usted puede usar el comando: * module load apps/valgrind/3.15 Versiones disponi...
YaggoVer
yaggo Es un software para Uso de yaggo Para cargar el módulo de yaggo usted puede usar el comando: * module load apps/yaggo/v1.5.10 Versiones disponibles de ya...
ZlibVer
Zlib Es un software para Uso de Zlib Para cargar el módulo de Zlib usted puede usar el comando: * module load zlib/1.2.11 Versiones disponibles de Zlib * v...
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