aliview

AliView es un editor/visor de alineamientos, optimizado para ser rápido aún con archivos extensos. El software esta instalado en los nodos hercules[1-7] del cluster de Biología Computacional.

Para ejecutarlo inicie una sesión ssh que le permita entornos graficos. Luego Solicite los recursos a usar en el cluster con una sesión SLURM interactiva y con entorno gráfico; por ejemplo, la línea a continuación inicia una sesión interactiva son srun y reserve todos los recursos disponibles en el nodo hercules2(-w hercules2), que esta incluido dentro del grupo o partición cpu.normal.q(-p cpu.normal.q), permitiendo entornos gráficos(--x), todo lo anterior en cluster biocomputo(-M biocomputo).

srun -M biocomputo -p cpu.normal.q --x -w hercules2 --pty /bin/bash -i
Topic attachments
I Attachment Action Size Date Who Comment
aliview.pngpng aliview.png manage 40 K 01 Dec 2022 - 17:01 AdminUser Ejecución de Aliview en el Cluster Bioinformática con SRUN y Sesion Grafica interactiva
Topic revision: r3 - 09 Jan 2023, AdminUser
This site is powered by FoswikiCopyright © by the contributing authors. All material on this collaboration platform is the property of the contributing authors.
Ideas, requests, problems regarding Foswiki? Send feedback